Peptydowy kwas nukleinowy (PNA) to sztuczna cząsteczka kwasu nukleinowego, która ma różne zalety w porównaniu z naturalnym DNA i RNA, takie jak wysoka selektywność, duże powinowactwo i stabilność. Synteza w fazie stałej jest jedną z głównych metod syntezy PNA, obejmującą następujące szczegółowe etapy:
Wybór odpowiednich grup zabezpieczających: Reakcja grup zabezpieczających z grupami aminowymi lub karboksylowymi na prekursorze PNA z wytworzeniem estrów lub amidów grup zabezpieczających.
Łączenie z żywicą polimerową: Prekursor PNA zmodyfikowany grupą zabezpieczającą łączy się z żywicą polimerową, zazwyczaj przy użyciu żywicy polimerowej o długości łańcucha węglowego wynoszącej 20-30 reszt aminokwasowych.
Powtarzanie cyklu syntezy: łącznie z usunięciem N-końcowej grupy zabezpieczającej; Dodaj następną jednostkę aminokwasu; Wykonaj ponownie zabezpieczenie końcówki N.
Odbezpieczanie i oddzielanie: Po syntezie łańcuch peptydowy PNA oddziela się od żywicy polimerowej poprzez obróbkę alkaliczną lub hydrolizę kwasową i usuwa się wszystkie grupy zabezpieczające w celu otrzymania produktu PNA.
Metodą tą można skutecznie syntetyzować cząsteczki PNA o długości do kilkuset nukleotydów, a syntetyzowane produkty charakteryzują się dużą czystością, dzięki czemu nadają się do produkcji na dużą skalę
Jednakże w zastosowaniach praktycznych czystość PNA agregowanego przez ogólne automatyczne syntezatory nie jest idealna. Instytut Badawczy HiPep opracował nowatorską metodę syntezy, która może zapewnić produkty PNA o wysokiej czystości. Metoda ta rozwiązuje niektóre problemy tradycyjnej syntezy, takie jak wysokie ceny składników, łatwa zawada przestrzenna grup ochronnych i znaczący wpływ czystości monomeru na aktywność biologiczną docelowego PNA. Standardowy zakres syntezy to 10-15 zasad, a dla syntezy powyżej 16 baz jest to zamówienie specjalne wymagające osobnego kontaktu z dostawcą
Ponadto synteza PNA obejmuje również różne metody modyfikacji, takie jak modyfikacja fluorescencji, modyfikacja biotyny, modyfikacja peptydów, glikozylacja i modyfikacja DNA, aby sprostać różnym potrzebom badawczym. Dlatego bardzo ważny jest wybór odpowiednich metod i technik syntezy w oparciu o konkretne zastosowanie scenariusze i wymagania.
