Peptyd składa się z krótkiej sekwencji aminokwasów połączonych wiązaniami peptydowymi.
Synteza peptydów jest aktywną dziedziną chemii białek i peptydów, która zazwyczaj polega na sekwencyjnym dodawaniu aminokwasów w określonej kolejności w celu utworzenia łańcucha peptydowego metodami chemicznymi. Głównymi metodami syntezy są synteza w fazie ciekłej i fazie stałej. W porównaniu do LPPS, SPPS ma tę zaletę, że jest szybszy, prostszy, powoduje mniej reakcji ubocznych i wyższą wydajność.
Standardowa metoda SPPS, obejmująca strategie Boc (benzyl) i Fmoc (tBu).
Strategia Boc (benzyl).
W tym podejściu do syntezy jako stałe nośniki stosuje się chlorometylowane, hydroksymetylowane żywice polistyrenowe i p-metoksybenzylowe (PMA). Grupę -aminową zabezpiecza się t-butoksykarbonylem (Boc), natomiast grupy bocznych łańcuchów aminokwasów zabezpiecza się pochodnymi benzylowymi. Grupę Boc usuwa się za pomocą czystego TFA lub TFA w CH2Cl2, a na koniec syntezy grupy zabezpieczające łańcuchy boczne i wiązania peptyd-żywica usuwa się mocnym kwasem, takim jak bezwodny kwas fluorowodorowy (HF) lub TFMSA.
Strategia Fmoc (tBu).
W tym podejściu do syntezy jako stałe nośniki stosuje się żywicę Wanga, 2-żywicę chlorku chlorotritylu, żywicę Rink amide-AM i żywice Rink amide-MBHA. Grupa -aminowa jest zabezpieczona 9-fluorenylometoksykarbonylem (Fmoc ), podczas gdy grupy łańcuchów bocznych aminokwasów są zabezpieczone grupami zabezpieczającymi nietrwałymi w środowisku kwasowym. Grupę Fmoc usuwa się za pomocą 20% piperydyny w DMF, a na koniec syntezy grupy zabezpieczające łańcuchy boczne i wiązania peptyd-żywica usuwa się za pomocą 1%-95% TFA. Obecnie preferowaną metodą syntezy peptydów jest Fmoc SPPS.