Słowniczek

Telefon

+86-0755 2308 4243
Adres

Pokój 309, budynek Meihua, tajwański park przemysłowy, nr 2132 Songbai Road, dystrykt Bao'an, Shenzhen, Chiny
Adres e-mail

sales@biorunstar.com

Słowniczek

2-Abz

2-Abz - 2-aminobenzoil, zwykle łączy się z 2,4-dinitrofenylem (Dnp) lub 3-nitro-tyrozyną (NitroTyr), tworząc pary fluorofor/wygaszacz. wzbudzenie przy 320 nm, emisja przy 420 nm.

3-Abz

3-Abz (kwas m-aminobenzoesowy) można postrzegać jako -aminokwas. Kiedy kwas m-aminobenzoesowy zostaje włączony do łańcuchów peptydowych, powstaje sztywny skręt.

4-Abz

4-Abz (kwas p-aminobenzoesowy, PABA), będący naturalnie występującą pochodną kwasu benzoesowego, można również zastosować jako sztywny liniowy odstępnik.

Abu

Abu, kwas L- -aminobutyryl ((S)-2-amino-butanoilo), kwas -aminomasłowy, jest pochodną aminokwasu. Ze względu na swoje strukturalne podobieństwo do naturalnych aminokwasów jest często stosowany w projektowaniu i syntezie peptydów i mimetyków peptydów.

Ac oznacza acetyl. Acetylacja N-końcowa jest powszechną modyfikacją stabilizującą peptydy w przyrodzie.

Dop

Acm, acetamidometyl, można usunąć za pomocą Hg(II) lub Ag(I). Jest to jedna z powszechnie stosowanych grup zabezpieczających tiol cysteiny podczas syntezy peptydów z wieloma wiązaniami dwusiarczkowymi.

ACTH

ACTH (hormon adrenokortykotropowy) to hormon wydzielany przez przedni płat przysadki mózgowej, który pobudza korę nadnerczy do wytwarzania kortykosteroidów.

Ada

Aad (kwas L- -aminoadypinowy) jest aminokwasem nieproteinogennym. Jego budowa jest podobna do kwasu glutaminowego (Glu), z dodatkową grupą metylenową w łańcuchu bocznym.

AEA

Kwas (2-aminoetoksy)octowy, znany również jako ester etylowy glicyny lub etyloamid glicyny, można stosować jako odstępnik lub łącznik w syntezie modyfikacji peptydów.

Adop

1-(1'-adamantyl)-1-metylo-etoksykarbonyl, bardzo nietrwała w środowisku kwasowym grupa zabezpieczająca grupę aminową w syntezie peptydów, można odbezpieczyć za pomocą 3% TFA/CH2Cl2

AFC

AFC (7-Amino-4-trifluorometylokumaryna) jest związkiem fluorescencyjnym powodującym wzbudzenie uwolnionej kumaryny przy 395-400 nm i emisję przy 495-505 nm.

Zbiór

Substancje o większej masie cząsteczkowej powstają w wyniku niekowalencyjnej adhezji mniejszych cząsteczek. W szczególności w białkach agregacja jest formą denaturacji, która może wystąpić na niepolarnych powierzchniach ze strukturami drugorzędowymi, takimi jak te, które zazwyczaj tworzą interakcje wewnątrzcząsteczkowe i są ukryte w -helisach i -arkuszach białka. Cząsteczki oddziałują ze sobą, czasami tworząc nierozpuszczalne formy wielocząsteczkowe. Agregacja kontrastuje z oligomeryzacją, normalną interakcją prawidłowo sfałdowanych białek natywnych w celu utworzenia polimerów wyższego rzędu.

Wymienniki AHX

AHX, kwas aminoheksanoilowy,6-aminoheksanowy, w skrócie Aca lub LC, zwykle wprowadzany jako krótki niepolarny odstępnik pomiędzy biotyną, fluoroforami i sekwencjami peptydowymi.

Aib powiedział:

2-Kwas aminoizomasłowy to rzadki aminokwas niebiałkowy, będący produktem końcowym metabolizmu pirymidyny, wydalany z moczem i obecny w niektórych antybiotykach pochodzenia grzybowego. Stosowany również do zastąpienia naturalnych aminokwasów w syntezie peptydów.

Alkohole

Alkohole to związki organiczne, które charakteryzują się obecnością jednej, dwóch lub więcej grup hydroksylowych (-OH), które są przyłączone do atomu węgla w grupie alkilowej lub łańcuchu węglowodorowym. Alkohole peptydowe to związki o kluczowym znaczeniu klinicznym, które nie są dostatecznie zbadane w badaniach zależności struktura-aktywność (SAR) pod kątem odkrywania leków. Na przykład DAMGO jest agonistą receptora opioidowego modyfikowanym alkoholem na C-końcu, o sekwencji Tyr-{d-Ala}-Gly-{Me-Phe}-Gly-ol. Posiada wysoką selektywność i powinowactwo do receptora μ-opioidowego.

Aldehyd

Aldehyd jest związkiem organicznym, w którym grupa karbonylowa jest przyłączona do atomu węgla na końcu łańcucha węglowego. Aldehydy peptydowe są ważnymi narzędziami w biochemii i biologii chemicznej do hamowania i chemicznego unieszkodliwiania proteaz.

Aloc

Aloc – Alliloksykarbonyl, grupa zabezpieczająca grupę aminową (w skrócie Alloc). Ochronę można usunąć za pomocą Pd(PPh3)4.

Choroba Alzheimera

Choroba Alzheimera, charakteryzująca się obecnością płytek amyloidowych i splątków tau, wynika z dysfunkcji synaptycznej i problemów ze szlakiem oczyszczania, powodując upośledzenie funkcji poznawczych.

AMC

7-Amino-4-metylokumaryna (AMC) to powszechna sonda fluorescencyjna do znakowania peptydów w badaniach proteaz. Jego koniugacja z peptydem wygasza sygnał fluorescencyjny, a uwolniona AMC po rozszczepieniu proteazą może określić ilościowo aktywność enzymu, z maksimami wzbudzenia/emisji wynoszącymi 345/445 nm. Na przykład preferowany substratowy peptyd fluorescencyjny do oznaczania aktywności trypsynopodobnej oczyszczonego proteasomu o sekwencji: Ac-Arg-Leu-Arg-AMC.

ANP (Agencja Lotnic

Przedsionkowy peptyd natriuretyczny (ANP), hormon wytwarzany i uwalniany przez przedsionki serca w odpowiedzi na zwiększoną objętość krwi i ciśnienie. Reguluje równowagę płynów i ciśnienie krwi poprzez promowanie rozszerzenia naczyń, zwiększenie produkcji moczu (diureza) i zmniejszenie wchłaniania zwrotnego sodu w nerkach. Działania te pomagają przeciwdziałać skutkom wysokiego ciśnienia krwi i przeciążenia płynowego organizmu.

Peptydy antygenowe

Peptydy antygenowe to krótkie sekwencje aminokwasów pochodzące z białek lub innych biomolekuł, które wyzwalają odpowiedź immunologiczną organizmu. Peptydy te są rozpoznawane przez układ odpornościowy jako obce lub obce dla organizmu, co prowadzi do aktywacji komórek odpornościowych, takich jak komórki T i komórki B. Peptydy antygenowe odgrywają kluczową rolę w odpowiedziach immunologicznych, w tym adaptacyjnej produkcji przeciwciał i rozwoju pamięci immunologicznej. Są one szeroko badane w immunologii i opracowywaniu szczepionek ze względu na ich potencjał wywoływania specyficznych odpowiedzi immunologicznych przeciwko patogenom lub nieprawidłowym komórkom.

Asymetryczny rozgałęziony peptyd

Syntezę asymetrycznych peptydów z 2, 4 i 8 gałęziami można osiągnąć poprzez strategiczne wstawienie lizyny, argininy lub kwasu glutaminowego do sekwencji peptydowej.

Asymetryczna dimetyloarginina (ADMA)

Asymetryczna dimetyloarginina (ADMA, Arg(Me)2) to naturalnie występujący związek chemiczny i endogenny inhibitor syntazy tlenku azotu (NOS). Fmoc-Arg(Me)2-OH (asymetryczny) można bezpośrednio zastosować do syntezy peptydów zawierających asymetryczną dimetyloargininę.

Ava

5-Kwas aminowalerianowy można stosować jako odstępnik lub łącznik w syntezie modyfikacji peptydów.

Benzyloksymetyl

Benzyloksymetyl (Bom) to nietrwała w środowisku kwasowa imidazolowa grupa zabezpieczająca stosowana w procesie Boc-SPPS dla peptydów zawierających histydynę. Po potraktowaniu kwasem benzyloksymetyl wytwarza wysoce reaktywny formaldehyd. Dlatego Bom najlepiej rozszczepia się w obecności Cys, metoksyaminy lub innych związków reagujących z aldehydami.

Beta ( )-aminokwas

-aminokwasy mają grupę aminową przyłączoną do -węgla, który jest drugim atomem węgla od grupy karboksylowej. Ogólny wzór strukturalny -aminokwasu można przedstawić jako: R-CH(NH2)-COOH

Sieć BNP

Peptyd natriuretyczny typu B (BNP), hormon wytwarzany głównie przez komory serca w odpowiedzi na nadmierne rozciąganie komórek mięśnia sercowego. Odgrywa kluczową rolę w regulacji ciśnienia krwi i równowagi płynów, przede wszystkim poprzez promowanie rozszerzenia naczyń i zwiększenie wydalania sodu przez nerki.

Boc

t-butyloksykarbonyl (Boc) jest grupą zabezpieczającą grupę aminową bardzo wrażliwą na kwasy w syntezie peptydów, można ją odszczepić za pomocą TFA/chlorku metylenu (1:1), HCl w octanie etylu lub dioksanie, 98% kwas mrówkowy.

Protokół Bpoc

2-(4-Bifenylo)izopropyloksykarbonyl (Bpoc) jest grupą zabezpieczającą grupę aminową bardzo nietrwałą wobec kwasu w syntezie peptydów, można ją odszczepić za pomocą 1% TFA/chlorku metylenu.

Rozgałęziony peptyd

Peptydy z 2, 4 i 8 rozgałęzieniami można uzyskać poprzez strategiczne wstawienie lizyny, argininy lub kwasu glutaminowego do sekwencji peptydowej.

Bsi

t-butylodimetylosilil (TBS lub TBDMS) oznacza grupę zabezpieczającą grupę hydroksylową zgodną z Fmoc-SPPS. Jest nietrwały w środowisku kwasowym i może być selektywnie rozszczepiany przez jony fluorkowe.

Bz - benzoil

Benzoil to grupa acylowa często wprowadzana na N-końcu peptydów. Jest mniej polarny niż acetyl (Ac) i może stanowić trwałą modyfikację.

Bzl – benzyl

Benzyl (Bzl) reszta alkilowa i grupa zabezpieczająca łańcuch boczny stosowana do blokowania alkoholi (Ser, Thr, Hyp) w syntezie peptydów. można go rozszczepić za pomocą mocnych kwasów lub katalitycznej wodorolizy (np. wodór/Pd).

CCK (Wspólnota Przemysł

Cholecystokinina (CCK) to hormon peptydowy wytwarzany przez błonę śluzową jelita górnego i występujący w ośrodkowym układzie nerwowym. Pobudza skurcz pęcherzyka żółciowego, uwalnianie enzymów trzustkowych, wpływa na różne procesy żołądkowo-jelitowe.

CGRP (Protokół CGRP)

Peptyd związany z genem kalcytoniny (CGRP) to 37-peptyd aminokwasowy spokrewniony z kalcytoniną, amyliną i adrenomedulliną. Występuje w dwóch postaciach, -CGRP (CGRP I) i -CGRP (CGRP II), o podobnych aktywnościach biologicznych. CGRP występuje głównie w neuronach czuciowych i ośrodkowych, wpływając na czynność układu sercowo-naczyniowego, metabolizm wapnia i napięcie naczyń płodowo-łożyskowych. Jego receptory są sprzężone z białkiem G i aktywują cyklazę adenylanową, oddziałując z białkami modyfikującymi aktywność receptora (RAMP) w celu uzyskania specyficzności ligandów i transportu komórkowego.

Cza

L-Cykloheksylalanina (Cha) jest niepolarnym analogiem aminokwasu fenyloalaniny, w którym pierścień aromatyczny zastąpiono pierścieniem cykloheksanowym. To podstawienie umożliwia badanie roli aminokwasów aromatycznych w interakcjach, takich jak interakcje π-π, poprzez zastąpienie reszt fenyloalaniny Cha w eksperymentach.

Chg

L- -Cykloheksyloglicyna (Chg) jest niepolarnym aminokwasem z zawadą przestrzenną. Służy jako znaczący półprodukt farmaceutyczny i występuje również w produktach naturalnych.

Cholesterol

Cholesterol jest wytwarzany naturalnie przez wątrobę i inne komórki organizmu, ale może również pochodzić z pożywienia, które spożywamy, zwłaszcza z produktów pochodzenia zwierzęcego, takich jak mięso, drób i pełnotłuste produkty mleczne. Cholesterol można łączyć z peptydami w celu poprawy farmakokinetyki.

Cis-Hip

cis-Hydroksyprolina, stereoizomer naturalnej trans-hydroksyproliny.

Cyt

Cytrulina występuje w białkach w wyniku potranslacyjnej enzymatycznej modyfikacji reszt argininy.

Kontroler CMK

CMK jest inhibitorem kinazy RSK2 o podobnej sile działania, ale mniejszej stabilności chemicznej niż FMK.

Sieć CNP (Kanał

Peptyd natriuretyczny typu C (CNP) to peptyd wytwarzany przez komórki śródbłonka naczyń, znany ze swojego działania rozszerzającego naczynia. Wykazuje strukturalne i fizjologiczne podobieństwo do przedsionkowych i mózgowych peptydów natriuretycznych (ANP i BNP).

Język Cpg

L- -Cykopentyloglicyl (Cpg) jest niepolarnym aminokwasem z zawadą przestrzenną.

Terminal C

W sekwencji peptydowej ta unikalna reszta, która jest połączona z sekwencją liniową przez swoją grupę aminową, pozostawiając ją z wolną grupą karboksylową. Grupa karboksylowa tej reszty może podlegać modyfikacjom, takim jak amidowanie lub, w przypadkach takich jak piroglutaminian, wewnętrzna laktamizacja.

Cy3 powiedział:

Cyjanina 3 to czerwono-fluorescencyjny barwnik cyjaninowy, zwykle wzbudzany przez źródło światła o długości fali około 558 nm i emitujący światło o długości fali około 572 nm.

Cy5 powiedział:

Cyjanina 5 to fluorofor barwnika cyjaninowego, który emituje fluorescencję w bliskiej podczerwieni, zwykle wzbudzaną przez źródło światła o długości fali około 646 nm i emitującą światło o długości fali około 664 nm.

Zimnica

Kwas L-,-diaminomasłowy jest ,ω-diaminokwasem, krótszym analogiem ornityny (Orn) i lizyny (Lys). Przy odpowiedniej ochronie ,ω-diaminokwasy można selektywnie modyfikować w ich pozycji Nω lub włączać w celu utworzenia rozgałęzionych peptydów lub dendrymerów.

DABCYL

Kwas 3-(dimetyloaminoazo)benzeno-4-karboksylowy to chromofor połączony z grupami aminowymi stosowany w biochemii i biologii molekularnej jako czynnik wygaszający w rezonansowym transferze energii fluorescencji (FRET), np. w EDANS. Wzbudzenie DABCYL przy 454 nm.

Dabsyl powiedział:

Dabsyl,4-chlorek dimetyloaminobenzenosulfonylu. Chromofor połączony z grupami aminowymi stosowany jako środek wygaszający w połączeniu np. z EDANS. Wzbudzenie Dabsylu przy 436 nm.

DANSYL

4-Dimetyloamino-1-naftalenosulfonyl, fluorofor połączony z grupami aminowymi, wzbudzenie przy 342 nm, emisja przy 562 nm.

Dap

Kwas L-,-diaminopropionowy (Dap lub Dpr) to ,ω-diaminokwas, będący krótszym analogiem kwasu diaminomasłowego (Dab), ornityny (Orn) i lizyny (Lys). Zmodyfikowane pochodne ,ω-diaminokwasów można selektywnie zmieniać w ich pozycji Nω lub włączać w celu utworzenia rozgałęzionych peptydów lub dendrymerów.

Tak

1-(4,4-Dimetylo-2,6-dioksocykloheks-1-ylideno)etyl (Dde) to grupa zabezpieczająca grupę aminową stosowaną w syntezie peptydów. Można go selektywnie rozszczepić za pomocą 2% hydratu hydrazyny w dimetyloformamidzie (DMF). Nω-Dde umożliwia specyficzne usunięcie Dde z aminokwasów, takich jak Dap, Dab, Orn lub Lys, po syntezie peptydu na fazie stałej Fmoc (SPPS), ułatwiając modyfikację grupy Nω-aminowej na żywicy.

Dwusiarczek

Wiązania dwusiarczkowe to wiązania kowalencyjne utworzone pomiędzy dwiema grupami sulfhydrylowymi (-SH) reszt cysteiny w białkach.

Biblioteka danych

2,4-dimetoksybenzyl to nietrwała w środowisku kwasowym formamidowa grupa zabezpieczająca stosowana do odwracalnej modyfikacji szkieletu w syntezie peptydów. Są one włączane podczas syntezy peptydów w fazie stałej (SPPS) jako aminokwas lub dipeptyd Fmoc-Dmb (Fmoc-Xaa-DmbYaa-OH), gdzie Fmoc zapobiega agregacji peptydu, a tym samym sprzyja wydajnemu wydłużaniu. Dmb wspomaga również reakcje cyklizacji i zapobiega tworzeniu się asparagimidu. W przeciwieństwie do pochodnych Hmb, Dmb nie tworzy benzoksazepin podczas aktywacji.

Dnp - 2,4-Dinitrofenyl

2,4-Dinitrofenyl to chromofor sprzężony z grupami aminowymi, powszechnie stosowany jako środek wygaszający w substratach do transferu energii rezonansu fluorescencyjnego (FRET).

Dod

4,4′-Dimetoksydityl, znany również jako bis-(4-metoksyfenylo)metyl, to nietrwała w środowisku kwasowym grupa zabezpieczająca karboksyamid, która jest zgodna z syntezą peptydów w fazie stałej Fmoc (SPPS).

DOPA

DOPA, 3,4-dihydroksyfenyloalanina, jest prekursorem kilku kluczowych neuroprzekaźników, w tym dopaminy, noradrenaliny i epinefryny.

DOTA (Agencja Prywatności)

Kwas (4,7,10-trikarboksymetylo-1,4,7,10-tetraazacyklododecylo)octowy, w skrócie DOTA, jest cyklicznym chelatorem zwykle przyłączonym do N-końca peptydów. DOTA ułatwia znakowanie peptydów radionuklidami, takimi jak 68Ga lub 90Y, do różnych zastosowań biomedycznych, w tym obrazowania i terapii celowanej.

Dpm

Difenylometyl (dityl), nietrwała w środowisku kwasowym grupa zabezpieczająca N-, O- i S.

Umowa DTPA

Kwas dietylenotriaminopentaoctowy (DTPA) jest użytecznym środkiem chelatującym radionuklidy, takie jak (68)Ga, (99m)Tc i (111)In, które mają zastosowanie w obrazowaniu medycyny nuklearnej.

EDANY

Kwas 5-[(2-Aminoetylo)amino]naftalen-1-kwas sulfonowy (EDANS) to fluorofor powszechnie związany z Nω diaminokwasów, takich jak lizyna. Jest często stosowany w podłożach FRET, zwykle w połączeniu z wygaszaczami, takimi jak DABCYL. EDANS ma długość fali wzbudzenia 340 nm i emituje przy 490 nm.

Protokół EMAP

Śródbłonkowy polipeptyd aktywujący monocyty.

Etyl, grupa alkilowa i homolog metylu (Me), służy do trwałych modyfikacji N- i S-etylowania w peptydach.

Mapowanie epitopów

Mapowanie epitopów (mapowanie epitopów antygenów) to technika stosowana do określenia specyficznych obszarów (tj. epitopów antygenu) na antygenie, które mogą być rozpoznawane przez przeciwciała lub układ odpornościowy. Epitopy antygenów można podzielić na epitopy liniowe i epitopy konformacyjne. Dzięki mapowaniu epitopów antygenu możemy głęboko zrozumieć związek między strukturą i funkcją antygenu, co ma ogromne znaczenie w opracowywaniu szczepionek, diagnostyce chorób, immunoterapii i innych aspektach.
Niektóre powszechnie stosowane metody mapowania epitopów antygenu obejmują:
Krystalografia rentgenowska: Może bezpośrednio analizować trójwymiarową strukturę antygenu, określając w ten sposób położenie epitopu.
Jądrowy rezonans magnetyczny: można go również zastosować do analizy struktury antygenu w celu określenia epitopu.
Technika skanowania peptydów: zastosowanie serii nakładających się syntetycznych segmentów peptydowych w celu identyfikacji epitopu, który wiąże się z przeciwciałem.
Na przykład w badaniach i rozwoju szczepionek wyjaśnienie kluczowych epitopów antygenu pomaga zaprojektować skuteczniejsze szczepionki i wywołać bardziej ukierunkowaną odpowiedź immunologiczną; w diagnostyce chorób określenie epitopów antygenowych związanych z określonymi chorobami może pomóc w opracowaniu dokładniejszych odczynników diagnostycznych.

5-FAM

5-FAM (5-karboksyfluoresceina) to fluorofor powszechnie stosowany do znakowania biomolekuł, o długości fali wzbudzenia 490 nm i emisji przy 520 nm.

6-FAM

Fluoresceina-6-karbonylowa to fluorofor przyłączony do grup aminowych, o długości fali wzbudzenia 490 nm i emisji przy 520 nm.

Międzynarodowa Federacja Piłki Nożnej (

Izotiocyjanian fluoresceiny (FITC) to fluorofor, który reaguje z grupami aminowymi. Podczas znakowania peptydu na jego N-końcu za pomocą FITC, zwykle wstawia się odstępnik, taki jak -alanina lub Ahx. FITC ma długość fali wzbudzenia 490 nm i emisję przy 520 nm.

9-Fluorenylometyl to nietrwała w zasadach grupa zabezpieczająca stosowana do zabezpieczania O i S.

FMK (Przedsiębiorstwo FMK

FMK, keton fluorometylowy, jest nieodwracalnym inhibitorem kinazy RSK2.

Fmoc

9-Fluorenylometoksykarbonyl (Fmoc), grupę zabezpieczającą grupę aminową w syntezie FMOC w fazie stałej, można usunąć za pomocą 20% piperydyny/DMF.

Dla

Formyl to grupa zabezpieczająca indol stosowana w Boc-SPPS. Trp(For) ulega rozszczepieniu za pomocą HF w obecności merkaptanu lub zasad, takich jak piperydyna.

DENERWOWAĆ

Transfer energii rezonansu fluorescencji (FRET) to transfer energii niepromienistej ze wzbudzonego fluoroforu (dawcy) do odpowiedniego akceptora (wygaszacza). Transfer zależy od odległości, orientacji dipola i nakładania się widm donora i akceptora. W substratach FRET fluorofor i wygaszacz są połączone łańcuchem peptydowym. Rozszczepienie enzymatyczne zwiększa fluorescencję poprzez oddzielenie donora i akceptora.

Fluorescencja

Fluorescencja to światło emitowane przez substancję pochłaniającą światło lub inne promieniowanie elektromagnetyczne. Dzieje się tak, gdy cząsteczki zwane fluoroforami absorbują fotony o określonej długości fali, ulegają wzbudzeniu, a następnie emitują fotony i powracają do stanu podstawowego. Emitowane światło ma zazwyczaj dłuższą długość fali i niższą energię niż światło pochłonięte, co skutkuje charakterystycznym widmem fluorescencji. Zjawisko to jest szeroko stosowane do różnych celów naukowych i medycznych, w tym w mikroskopii, cytometrii przepływowej i spektroskopii fluorescencyjnej.

GIP

Polipeptyd hamujący żołądek (GIP), znany również jako peptyd insulinotropowy zależny od glukozy, należy do rodziny hormonów sekretyn. Pobudza wydzielanie insuliny, hamuje wydzielanie kwasu żołądkowego, odgrywa kluczową rolę w regulacji wydzielania insuliny i homeostazy glukozy.

Gla

L- -Kwas karboksyglutaminowy (Gla) powstaje w wyniku potranslacyjnej karboksylacji kwasu glutaminowego, w wyniku czego powstają białka zdolne do wiązania jonów wapnia, takie jak osteokalcyna. Peptydy zawierające Gla idealnie syntetyzuje się przy użyciu syntezy peptydów w fazie stałej Fmoc (SPPS), ponieważ Gla może ulegać dekarboksylacji z wytworzeniem kwasu glutaminowego w obecności mocnych kwasów.

Dobra praktyka laboratoryjna

Peptydy glukagonopodobne należą do nadrodziny glukagonu hormonów peptydowych pochodzących z C-końcowego regionu proglukagonu. Są syntetyzowane głównie przez komórki L jelit.

GnRH (Wilgotność względna)

Hormon uwalniający gonadotropinę (LHRH) jest hormonem dekapeptydowym wytwarzanym w komórkach neurosekrecyjnych podwzgórza i uwalnianym w pulsacyjnych wybuchach do krążenia wrotnego przysadki mózgowej. Pulsacyjne wydzielanie ma kluczowe znaczenie dla funkcji rozrodczych, rozwoju płciowego i różnicowania.

GRF

Hormon uwalniający hormon wzrostu (GHRH), znany również jako somatorelina, to podwzgórzowy hormon peptydowy, który stymuluje przysadkę mózgową do uwalniania i syntezy hormonu wzrostu.

Tworzywa sztuczne (GRP)

Hormon uwalniający hormon wzrostu (GHRH), znany również jako somatorelina, to podwzgórzowy hormon peptydowy, który stymuluje przysadkę mózgową do uwalniania i syntezy hormonu wzrostu.

HLA (Język HLA)

Ludzki antygen leukocytowy (HLA) odnosi się do grupy białek znajdujących się na powierzchni komórek, które odgrywają kluczową rolę w rozpoznawaniu obcych substancji przez układ odpornościowy. Są kodowane przez geny głównego układu zgodności tkankowej (MHC) u ludzi i są niezbędne do prezentacji antygenów limfocytom T, umożliwiając układowi odpornościowemu rozróżnienie komórek własnych od komórek obcych. Cząsteczki HLA są bardzo zróżnicowane i polimorficzne, co znacząco wpływa na indywidualną odpowiedź immunologiczną i podatność na choroby autoimmunologiczne i odrzucenie przeszczepu.

Hmb powiedział:

2-hydroksy-4-metoksybenzyl to nietrwała w środowisku kwasowym formamidowa grupa zabezpieczająca stosowana do odwracalnej modyfikacji szkieletu w syntezie peptydów. Jest włączany jako aminokwas lub dipeptyd Fmoc-Hmb (Fmoc-Xaa-HmbYaa-OH) podczas syntezy peptydu Fmoc w fazie stałej (SPPS), zapobiegając agregacji i umożliwiając wydajne wydłużanie peptydu. Hmb pomaga również w reakcjach cyklizacji i zapobiega tworzeniu się asparaginy.

Har

L-Homoarginina jest homologiem L-argininy, w skrócie Har, i można ją znaleźć w osoczu i moczu. Homoarginina powstaje w wyniku guanidynacji lizyny, którą można przeprowadzić również na peptydach i białkach.

HCI

Homocytrulina jest homologiem L-cytruliny, w skrócie Hci, i można ją wykryć w ludzkim moczu.

Hcy

L-homocysteina jest homologiem cysteiny, w skrócie Hcy, wytwarzaną w wyniku demetylacji metioniny. Podwyższony poziom Hcy we krwi jest czynnikiem ryzyka chorób sercowo-naczyniowych i neurodegeneracyjnych. W przeciwieństwie do pochodnych Cys, pochodne Hcy nie ulegają racemizacji podczas sprzęgania ani nie eliminują.

Hle powiedział:

Homologi L-leucyny, w skrócie Hle.

Godzina na godzinę

Homofenyloalanina, homolog fenyloalaniny, w skrócie Hph, jest składnikiem ACE i inhibitorów reniny. Fmoc-Homophe-OH jest potencjalnym lekiem przeciwzapalnym.

HPr

L-homoprolina lub kwas L-pikolowy, w skrócie Pip lub Hpr. Homolog proliny Hpr jest produktem degradacji L-lizyny. Obydwa enancjomery można wykryć w ludzkim osoczu. Ponieważ reszty proliny silnie wpływają na konformację peptydu, zastąpienie Pro Hpr (lub kwasem azetydyno-2-karboksylowym (Aze)) może modulować jego strukturę drugorzędową.

Hip

L-transhydroksyprolina powstaje potranslacyjnie w wyniku utleniania proliny. Hyp jest głównym składnikiem kolagenu i białka małży.

Izoseryna

Izoseryna, izomer L-seryny, jest aminokwasem.

IvDde

ivDde, grupę zabezpieczającą grupę aminową, można odbezpieczyć i odszczepić za pomocą 2% hydratu hydrazyny w DMF. ivDde jest bardziej stabilny niż Dde, jeśli chodzi o częste wielokrotne leczenie piperydyną podczas Fmoc-SPPS. Nω-ivDde można selektywnie usunąć z Dap, Dab Orn lub Lys, umożliwiając postsyntetyczną modyfikację grupy Nω-aminowej na żywicy.

KLH powiedział:

Hemocyjanina skałoczepa dziurki (KLH) to duża, wielopodjednostkowa metaloproteina przenosząca tlen, występująca w hemolimfie hemocyjaniny skałoczepa olbrzymiego. Jako nośnik antygenu, KLH zwykle zwiększa immunogenność i zdolność wiązania antygenu poprzez sprzęganie docelowych sekwencji polipeptydowych, znacząco promując wytwarzanie wydajnych, swoistych i funkcjonalnych przeciwciał.

LHRH (Góra Ludowa)

Hormon uwalniający hormon luteinizujący (LHRH lub GnRH) to hormon dekapeptydowy syntetyzowany przez komórki neurowydzielnicze w podwzgórzu i uwalniany pulsacyjnie do krążenia wrotnego przysadki mózgowej. Pulsacyjne wydzielanie ma kluczowe znaczenie dla funkcji rozrodczych, rozwoju płciowego i różnicowania.

Konsolidator

Projektując i syntezując peptydy, badacze mogą wstawić łącznik pomiędzy biotyną lub fluorescencją a peptydami. Powszechnym hydrofobowym odstępnikiem jest kwas aminoheksanowy (Ahx), a powszechnym hydrofilowym odstępnikiem jest glikol poli(etylenowy) (PEG).

Liofilizowane

Proces liofilizacji, który usuwa ciecz z materiałów wrażliwych na ciepło. Materiał zamraża się, umieszcza pod wysoką próżnią i utrzymuje w niskich temperaturach. Ciśnienie wytworzone przez próżnię powoduje zmianę stanu lodu ze stanu stałego w gazowy bez przechodzenia przez stan ciekły. Peptydy są zwykle dostarczane w postaci liofilizowanego proszku.

LC-MS (Czujnik LC-MS)

Chromatografia cieczowa-spektrometria mas to wszechstronna technika analityczna, która integruje chromatografię cieczową ze spektrometrią mas w celu dostarczenia szczegółowych informacji na temat składu i struktury cząsteczek w złożonych próbkach.

MAPY

Wiele peptydów antygenowych. Peptyd wieloantygenowy to skuteczny sposób wytwarzania przeciwciał antypeptydowych o wysokim mianie i syntetycznych szczepionek peptydowych.

MALDI-MS

Spektrometria mas z desorpcją/jonizacją laserową wspomaganą matrycą (MALDI-MS) to technika analityczna stosowana do pomiaru stosunku masy do ładunku jonów. Jest szczególnie przydatny do analizy biomolekuł, takich jak peptydy, białka i polimery.

Spektrometria mas

Spektrometria mas (MS) to potężna technika analityczna stosowana do pomiaru stosunku masy do ładunku (m/z) jonów.

4M NA

4-Metoksy- -naftyloamid, w skrócie MNA, to fluorofor zwykle przyłączony do substratu karboksypeptydazy na C-końcu. Rozszczepiony 4M NA wzbudza się przy 335-350 nm i emituje przy 410-440 nm

Mbs (Mbs)

Metoksybenzenosulfonyl (Mbs) to guanidylowa grupa zabezpieczająca stosowana w syntezie peptydów w fazie stałej na bazie Boc (Boc-SPPS). Tę grupę zabezpieczającą można odbezpieczyć przez rozszczepienie fluorowodorem (HF).

Mbzl powiedział:

4-Metylobenzyl (Mbzl) to grupa zabezpieczająca grupę sulfhydrylową stosowaną w syntezie peptydów w fazie stałej na bazie Boc (Boc-SPPS). Mbzl jest bardziej stabilny niż metoksybenzyl (Mob) pod wpływem częstej obróbki kwasem trifluorooctowym (TFA) i można go usunąć przez rozszczepienie fluorowodorem (HF).

Mca

Kwas (7-metoksykumaryna-4-ylo)octowy (Mca) to fluorofor, który można połączyć z grupą aminową.
Mca wiąże się z dinitrofenylem (Dnp) w celu uzyskania substratów rezonansowego transferu energii fluorescencji (FRET). Długość fali wzbudzenia wynosi 325 nm, a długość fali emisji wynosi 392 nm.

MCH

Hormon koncentrujący melaninę (MCH) to cykliczny neuropeptyd wyizolowany po raz pierwszy od ryb i szczurów. MCH bierze przede wszystkim udział w regulacji pigmentacji skóry u doskonałokostnych ryb i zachowań żywieniowych u ssaków.

Metyl, najprostszy podstawnik alkilowy, bierze udział w N-, O- i S-metylacji, które stanowią trwałe modyfikacje peptydu.

Język MeOSuc

3- Metoksysukcynyl, odpowiadający deaminowanemu Asp(OMe), jest polarną N-końcową grupą blokującą powszechnie włączaną do substratów karboksypeptydazy.

Metylacja

Metylacja to modyfikacja potranslacyjna (PTM) peptydów i białek, podczas której grupa metylowa (-CH3) jest enzymatycznie dodawana do określonych reszt aminokwasowych, zwykle lizyny (Lys), argininy (Arg), histydyny (His) lub glutaminianu ( Glu). Modyfikacja ta może znacząco wpływać na funkcję, stabilność i interakcje białek z innymi cząsteczkami, odgrywając w ten sposób kluczową rolę w regulacji różnorodnych procesów komórkowych, w tym ekspresji genów, przekazywania sygnału i interakcji białko-białko.

Certyfikat MHC

Główny kompleks zgodności tkankowej (MHC) to region genetyczny zawierający geny kodujące cząsteczki MHC. Cząsteczki te odgrywają kluczową rolę w układzie odpornościowym i autoimmunizacji. U ludzi kompleks ten jest również znany jako układ ludzkiego antygenu leukocytowego (HLA).

MHC I

Cząsteczki MHC klasy I (MHC I) to białka na powierzchni komórek, które prezentują peptydy z wnętrza komórki cytotoksycznym komórkom T. Pomaga to komórkom odpornościowym rozpoznawać i niszczyć zakażone lub nieprawidłowe komórki, co jest kluczowe dla obrony immunologicznej przed patogenami i rakiem.

MHC II

Cząsteczki MHC klasy II (MHC II) to białka powierzchniowe komórki, które prezentują pomocniczym limfocytom T peptydy pochodzące z obcych substancji. Ta interakcja jest niezbędna do koordynowania odpowiedzi immunologicznych i aktywacji innych komórek odpornościowych przeciwko patogenom.

Arginina monometylacyjna

Monometylowana arginina (MMA) to modyfikacja potranslacyjna, w której pojedyncza grupa metylowa (-CH3) jest enzymatycznie dodawana do azotu guanidynowego reszty argininy w peptydzie lub białku

MPa

3-merkaptopropyloamina może być stosowana jako ligand peptydowy lub modyfikator w różnych zastosowaniach biochemicznych i biomedycznych.

Myr powiedział:

Mirystoilacja to proces modyfikacji lipidów, w którym grupa mirystoilowa składająca się z kwasu tłuszczowego nasyconego 14-węglem jest kowalencyjnie połączona z N-końcem peptydu. Modyfikacja ta służy zakotwiczeniu białka w błonie komórkowej, ułatwiając jego lokalizację i udział w różnorodnych procesach komórkowych.

1-Nal

-(1-naftylo)-L-alanina jest niepolarną pochodną aminokwasu podobną do fenyloalaniny, ale z grupą naftylową zamiast grupy fenylowej.

2-Nal

-(2-Naftylo)alanina jest niepolarną pochodną aminokwasu podobną do fenyloalaniny, ale z grupą naftylową zamiast grupy fenylowej.

NBD (Amerykański Urząd T

3-nitrobenz-2-oksa-1, 3-diazol (NBD) wprowadza się zwykle poprzez koniugację odczynnika NBD-Cl z peptydem. Peptydy znakowane NBD są powszechnie wybierane ze względu na ich użyteczność w badaniach skupiających się na błonach i biologii komórki.

NHEt

N-etyloamid można uznać za dekarboksylowaną formę C-końcowej alaniny. W buserelinie, agoniście LHRH, NHEt służy jako analog C-końcowego glicynamidu. Peptyd N-etyloamid jest odporny na degradację przez karboksypeptydazy.

Nle

L-norleucyna (Nle) jest stabilnym izosterem L-metioniny. Gdy aktywność biologiczna peptydu jest zagrożona z powodu tworzenia się sulfotlenku, Nle można zastąpić Met bez typowej zmiany jego zachowania funkcjonalnego.

UWAGA

NOTA, kwas 1,4,7-triazacyklonona-1,4,7-trioctowy, to dwufunkcyjny chelator, który służy jako podstawa do konstruowania narzędzi do obrazowania PET. Jest również wykorzystywany w projektowaniu sond i wzmacnianiu sygnału poprzez efekty wielowartościowe i ma potencjalne zastosowania jako diagnostyczny radiofarmaceutyk galu.

N-Ja

N-Me zwykle odnosi się do N-metylacji, modyfikacji chemicznej, w której grupa metylowa (-CH3) jest przyłączona do atomu azotu w cząsteczce, takiej jak N-Me-Gly, N-Me-Ser, N-Me -Tyr, N-Me-Thr, N-Me-Asp, N-Me-Glu, N-Me-Ala, N-Me-Phe, N-Me-Leu, N-Me-Ile, N-Me -Val , N-Me-Met, N-Me-Nle, N-Me-Nva itp.

NODAGA

NODAGA,1,4,7-triazacyklononan,1-kwas glutarowy-4,7-dioctowy, to wybitny dwufunkcyjny chelator do projektowania i rozwoju radiofarmaceutyków metaloorganicznych, oferujący znaczące potencjał zastosowań w diagnostyce obrazowej i radioterapii celowanej.

2-Nitrofenylotio (Nps) to grupa zabezpieczająca S stosowana w syntezie peptydów w fazie stałej w oparciu o Boc (Boc-SPPS). Można go rozszczepić za pomocą tioli, w szczególności przez wolną grupę sulfhydrylową cysteiny (Cys), co prowadzi do jednoczesnego utworzenia wiązania dwusiarczkowego.

NPY (Spółka NPY)

Neuropeptyd Y (NPY) jest ważnym neuropeptydem w mózgu i częścią rodziny neuropeptydów Y, która obejmuje polipeptyd trzustkowy (PP) i peptyd YY (PYY).

Nie

2-Nitro-2-pirydylosulfenyl (Npys) to grupa zabezpieczająca S, która jest zgodna z syntezą peptydów w fazie stałej opartą na Boc (Boc-SPPS). Npys można rozszczepić za pomocą tioli, w szczególności przez wolną grupę sulfhydrylową cysteiny (Cys), co powoduje jednoczesne utworzenie wiązania dwusiarczkowego.

Wirus Nva

Norwalina jest niepolarnym aminokwasem alifatycznym i homologiem kwasu -aminomasłowego (Abu).

-Naftyloamid jest fluoroforem powszechnie stosowanym w substratach karboksypeptydazy, zwykle połączonym na C-końcu peptydów. Rozszczepiony NA wzbudza się przy 330 nm i emituje przy 370 nm.

-Naftyloamid jest fluoroforem powszechnie stosowanym w substratach karboksypeptydazy, zwykle połączonym na C-końcu peptydów. Rozszczepiony NA przy 320-340 nm, emisja przy 410-420 nm.

OWszystkie

Ester allilowy to grupa zabezpieczająca karboksyl, która jest zgodna z syntezą peptydów w fazie stałej (SPPS) opartą zarówno na Fmoc, jak i Boc. Podobnie jak Aloc, estry allilowe można selektywnie usunąć poprzez działanie Pd(PPh3)4. W Fmoc-SPPS Asp(OAll) jest podatny na katalizowane zasadą tworzenie aspartimidu.

OBzl

Ester benzylowy, grupę zabezpieczającą karboksyl, można usunąć poprzez katalityczne uwodornienie (np. H2/Pd) lub mocnymi kwasami.

OcHex (OcHex)

OcHex to standardowa grupa zabezpieczająca karboksyl stosowana w syntezie peptydów w fazie stałej na bazie Boc (Boc-SPPS).

ODmab

Ester 4-(N-[1(4,4-dimetylo-2,6-dioksocykloheksylideno)-3-etylobutylo]amino)benzylowy (ODmab) to ester karboksylowy grupa stosowana w syntezie peptydów w fazie stałej w oparciu o Fmoc (Fmoc-SPPS). Można go odszczepić i odbezpieczyć stosując 2% hydrat hydrazyny w DMF.

ODmb

2,4-Ester dimetoksybenzylowy to wysoce nietrwała w środowisku kwasowym grupa zabezpieczająca karboksyl, którą można usunąć za pomocą 1% TFA w dichlorometanie.

OEt

Ester etylowy. Ze względu na rygorystyczne warunki wymagane do usuwania estrów etylowych, modyfikowanie peptydów estrami etylowymi może zwiększyć ich lipofilowość i stabilność.

Ofm

9-Ester fluorenylometylowy to nietrwała w warunkach zasad grupa zabezpieczająca karboksyl, którą można usunąć za pomocą piperydyny w DMF.

Och

Estry heksylowe. Ze względu na rygorystyczne warunki wymagane do usuwania estrów etylowych, modyfikowanie peptydów estrami etylowymi może zwiększyć ich lipofilowość i stabilność.

Oic

Kwas L-otahydroindol-2-karboksylowy (Oic) jest aminokwasem niepolarnym z zawadą przestrzenną. Insercja tego aminokwasu spokrewnionego z proliną do sekwencji polipeptydu silnie wpływa na konformację peptydu.

O mnie

Estry metylowe są półtrwałymi grupami zabezpieczającymi C-koniec w syntezie w fazie ciekłej i można je przekształcić w hydrazydy peptydowe, prekursory reaktywnych azydków peptydowych. Sprzęganie azydkowe pozostaje najpopularniejszą metodą sprzęgania fragmentów w syntezie peptydów w fazie ciekłej.

OMpe

Ester 3-metylopent-3-ylu (OMpe) to nietrwała w środowisku kwasowym grupa zabezpieczająca karboksyl, często stosowana do ochrony grupy karboksylowej kwasu asparaginowego (Asp) w syntezie peptydów w fazie stałej opartej na Fmoc (Fmoc-SPPS ).Ten bardziej wymagający sterycznie analog estru tert-butylowego został opracowany specjalnie w celu ograniczenia tworzenia się asparagimidu katalizowanego zasadą.

ONp

Estry orto-nitrofenylowe Boc- lub Z-aminokwasów są preaktywowanymi pochodnymi stosowanymi w syntezie roztworów peptydów.

Orn Orn (Orn)

Ornityna (Orn) jest wytwarzana z argininy podczas cyklu mocznikowego i można ją również zaobserwować w peptydach jako produkt degradacji argininy. Tworzenie ornów poprzez acylowanie reszty guanidynowej argininy jest częstą reakcją uboczną w syntezie peptydów.

System operacyjny

Ester hydroksysukcynimidu (OSu, w skrócie NHS) jest wstępnie aktywowaną pochodną aminokwasu, powszechnie stosowaną w syntezie peptydów, zwłaszcza w modyfikacji peptydów. Estry OSu są bezpieczne, niesteryczne, kompatybilne z układami wodnymi i łatwe w obsłudze.

OtBu - ester t-butylowy

Ester tert-butylowy, nietrwała w środowisku kwasowym grupa zabezpieczająca karboksyl aminokwasów w syntezie peptydów.

PABA

4-Kwas aminobenzoesowy (kwas paraaminobenzoesowy). Można go stosować do syntezy łączników koniugowanych przeciwciało-lek. Na przykład Mal-PEG2-Val-Cit-PABA jest rozszczepialnym łącznikiem koniugatu przeciwciało-lek (ADC).

PABC (Międzynarodowa Organizacja T

PABC (karbaminian paraaminobenzylu) to związek chemiczny stosowany w syntezie koniugatów przeciwciało-lek (ADC) jako łącznik. Ułatwia wiązanie leków z przeciwciałami w kontrolowany sposób, umożliwiając ukierunkowane dostarczanie leków w terapiach nowotworowych i innych zastosowaniach biomedycznych. Na przykład Mc-Val-Cit-PABC-PNP jest łącznikiem rozszczepialnym przez katepsynę stosowanym w koniugatach przeciwciało-lek (ADC).

PACAP

Polipeptyd aktywujący cyklazę adenylanową przysadki mózgowej (PACAP) jest wysoce konserwatywnym neuropeptydem ulegającym wyraźnej ekspresji w mózgu ssaków. Wywiera swoje działanie biologiczne poprzez zwiększanie wewnątrzkomórkowych poziomów cyklicznego AMP poprzez interakcję z receptorami.

Pam

Palmitoil, niepolarna grupa acylowa wprowadzona na N-końcu lub z boku. Palmitoilację zaobserwowano również jako potranslacyjną modyfikację białek.

PAM

Żywica metylowa fenyloacetamidowa to żywica zaprojektowana specjalnie do syntezy peptydów w fazie stałej na bazie Boc (Boc-SPPS). Peptydy syntetyzowane na tej żywicy można uwolnić poprzez rozszczepienie HF.

Ładunek

W koniugatach przeciwciało-lek (ADC) łącznik łączy przeciwciało z ładunkiem cytotoksycznym. Wybór ładunku ma kluczowe znaczenie, ponieważ determinuje skuteczność i specyficzność ADC w dostarczaniu terapii do tkanek docelowych poprzez specyficzne mechanizmy uwalniania.

Współczynnik Pbf

2,2,4,6,7-Pentametylodihydrobenzofuran-5-sulfonyl (Pbf) jest preferowaną grupą zabezpieczającą guanidynę stosowaną w syntezie peptydów w fazie stałej w oparciu o Fmoc (Fmoc-SPPS). Wykazuje nieco wyższą labilność kwasową w porównaniu do Pmc.

Pióro

Penicylamina jest analogiem L-cysteiny charakteryzującym się podstawieniem grupy metylowej (-CH3) kwasem karboksylowym (-COOH).

Samoorganizacja peptydów

Samoorganizacja peptydów ma miejsce wtedy, gdy peptydy w naturalny sposób układają się w uporządkowane struktury bez interwencji zewnętrznej. proces ten napędzany jest oddziaływaniami niekowalencyjnymi, takimi jak wiązania wodorowe, oddziaływania hydrofobowe, siły elektrostatyczne i układanie π-π. Samoorganizacja peptydów może prowadzić do tworzenia różnych nanostruktur, w tym włókien, kulek, arkuszy i żeli, które mają zastosowanie w materiałoznawstwie, biotechnologii i medycynie.

Fenylak

Fenyloacetyl (Phenylac lub Phac) to grupa acylowa zwykle połączona na N-końcu peptydów, charakteryzująca się niższą polarnością w porównaniu z acetylem (Ac). Stanowi trwałą modyfikację peptydów.

Protokół Phg

fenyloglicyna (Phg) jest pochodną aminokwasu, w której grupa fenylowa zastępuje atom wodoru w cząsteczce glicyny

Peptyd Histydyna Izoleucyna (PHI), peptyd świński spokrewniony z VIP i sekretyną.

PCH

Peptyd histydynametionina (PHM), ludzki peptyd powiązany z VIP.

LICZBA PI

Punkt izoelektryczny (pI) definiuje się jako poziom pH, przy którym białko/peptyd ma ładunek netto równy zero (Smoluch i in., 2016).

PMC

2,2,5,7,8-Pentametylochroman-6-sulfonyl (Pmc) to grupa zabezpieczająca guanidynyl powszechnie stosowana w syntezie peptydów w fazie stałej na bazie Fmoc (Fmoc-SPPS). Należy zauważyć, że jest nieco mniej nietrwały w kwasach w porównaniu do Pbf.

Pna

p-Nitroanilina, chromofor, jest zazwyczaj sprzężona z C-końcem substratów karboksypeptydazy. Absorpcję uwolnionej p-nitroaniliny mierzy się powszechnie przy długościach fali około 405 lub 410 nm.

Pra

L-propargiloglicyna (Pra) jest wytwarzana przez mikroorganizmy. Aminokwas ten, charakteryzujący się strukturą potrójnych wiązań, jest wysoko uważany za podstawową jednostkę do syntezy peptydów zdolnych do angażowania się w reakcje „chemii kliknięcia”, co przyciąga duże zainteresowanie w tej dziedzinie.

pTH

Parathormon (PTH) to hormon peptydowy uwalniany przez gruczoły przytarczyc, kluczowy dla utrzymania homeostazy wapnia i fosforu w płynie zewnątrzkomórkowym.

PTM

Modyfikacje potranslacyjne (PTM) białek dodają grupy funkcyjne lub białka, wycinają podjednostki regulatorowe lub rozkładają całe białka. Zmiany te, takie jak fosforylacja, glikozylacja, metylacja, acetylacja, lipidacja, ubikwitynacja, nitrozylacja i proteoliza, wpływają na normalne funkcjonowanie komórek i podczas choroby. Zrozumienie PTM ma kluczowe znaczenie dla badań podstawowych i znalezienia nowych metod leczenia.

Pir

kwas piroglutaminowy, znany również pod skrótami takimi jak Pgl, Glp, pGlu lub

fenyloazobenzylometoksykarbonyl to chromoforowa grupa zabezpieczająca N stosowana w syntezie peptydów, rozszczepiana przez uwodornienie katalityczne lub mocny kwas. Wykazuje maksymalną długość fali absorpcji przy 229 nm, 320 nm i 441 nm.

Pary wygaszające

Para wygaszacza składa się z cząsteczki fluorescencyjnej (fluoroforu) i cząsteczki wygaszacza stosowanej w badaniach i testach opartych na fluorescencji. Wygaszacz pochłania światło emitowane przez fluorofor, zmniejszając jego fluorescencję. Kiedy fluorofor i wygaszacz zostaną rozdzielone, na przykład w wyniku reakcji biochemicznej, sygnał fluorescencji wzrasta. Umożliwia to badaczom pomiar zmian i interakcji w czasie rzeczywistym. Technika ta jest powszechnie stosowana w zastosowaniach takich jak PCR w czasie rzeczywistym, sondy molekularne i testy FRET (Förster Resonance Energy Transfer).

Radioligandy

Fluor-18 jest radioligandem powszechnie stosowanym w obrazowaniu PET do oceny metabolizmu glukozy w tkankach oraz jest powszechnie stosowany w diagnostyce nowotworów i obrazowaniu mózgu.

Losowa biblioteka peptydów

Biblioteka losowych peptydów to zbiór wielu krótkich sekwencji peptydowych generowanych losowo. Każdy peptyd w bibliotece ma określoną liczbę aminokwasów o losowo określonych sekwencjach, tworząc różnorodny zakres cząsteczek peptydów. Naukowcy wykorzystują te biblioteki do przeszukiwania peptydów o określonych właściwościach, aktywności biologicznej lub interakcjach z cząsteczkami docelowymi. Są szczególnie przydatne w odkrywaniu leków, immunologii i badaniach interakcji białko-białko, pomagając w identyfikacji nowych leków i zrozumieniu złożonych procesów biologicznych.

Pozostałość(-y)

Reszta to pojedynczy aminokwas w peptydzie lub białku. Ponieważ aminokwasy łączą się ze sobą poprzez wiązania peptydowe, tworząc te łańcuchy, każdą jednostkę aminokwasową nazywa się resztą. Termin ten jest używany, ponieważ podczas tworzenia wiązania peptydowego każdy aminokwas traci cząsteczkę wody (H2O), pozostawiając po sobie tak zwaną resztę.

Żywica

Żywica to nierozpuszczalny polimer stosowany w syntezie peptydów w fazie stałej (SPPS) jako stały nośnik do ciągłego dodawania aminokwasów. Perełki żywicy zapewniają stabilną i obojętną powierzchnię, do której kowalencyjnie przyłączone są początkowe aminokwasy, umożliwiając budowę łańcucha peptydowego reszta po reszcie.

Rodamina B

Rodamina B to barwnik o barwie jasnoróżowej do czerwonej, o długości fali wzbudzenia zwykle około 540-570 nm i zakresie emitowanego światła wynoszącym 560-580 nm. Zwykle jest on sprzężony z sekwencją peptydu poprzez N-końcową grupę aminową peptydu

RP-HPLC

Wysokosprawny chromatograf cieczowy z odwróconą fazą.

SAR

Leki oparte na zależności struktura-aktywność (SAR) opracowywane są poprzez badanie związku między strukturą chemiczną leku a jego aktywnością biologiczną.

Sar

Sarkozyna, najprostszy N-alkilowany aminokwas.

Stężenie SDMA (SDMA)

Symetryczna dimetyloarginina (SDMA, Arg(Me)2), Fmoc-Arg(Me)2-OH (symetryczna) może być bezpośrednio wykorzystana do syntezy peptydów zawierających symetryczną dimetyloargininę.

SPPS (Programy SPPS)

Synteza peptydów w fazie stałej (SPPS) to metoda chemicznej syntezy peptydów, w której peptydy składa się stopniowo na stałym podłożu lub żywicy, poprzez kolejne dodawanie chronionych aminokwasów. SPPS obejmuje dwie strategie: Fmoc-SPPS i Boc-SPPS, które różnią się wyborem grup zabezpieczających grupę N-aminową (Fmoc lub Boc) i grup zabezpieczających łańcuch boczny. Rodzaj wybranej grupy zabezpieczającej N-amino narzuca strategię ochrony łańcucha bocznego i warunki ostatecznego odszczepienia peptydu od żywicy.

Sta

Statyna, w skrócie Sta, jest aminokwasem niebiałkowym często stosowanym w projektowaniu mimetyków peptydowych, szczególnie w syntezie inhibitorów proteaz.

StBu powiedział:

Tert-butylotio (StBu) to grupa zabezpieczająca S, która jest odszczepiana przez redukcję fosfiny i jest kompatybilna z Boc-SPPS.

Suc

Sukcynyl jest polarną N-końcową modyfikacją, która odpowiada deaminowanemu asparaginianowi i jest zazwyczaj włączana do substratów karboksypeptydazy.

TAMRA

TAMRA, w skrócie TMR, jest fluoroforem, który można przyłączyć do grupy aminowej. Jest często stosowany w połączeniu z FAM do podłoży FRET. TAMRA ma długość fali wzbudzenia 485 nm i długość fali emisji 535 nm.

tBu powiedział:

Tert-butyl to nietrwała w środowisku kwasowym grupa zabezpieczająca powszechnie stosowana w przypadku alkoholi i fenoli, którą można odszczepić za pomocą kwasu trifluorooctowego (TFA).

HERBATA

Fosforan trietyloamoniowy jest buforem stosowanym w fazach ruchomych HPLC z odwróconymi fazami.

Umowa o zachowaniu poufności

Kwas trifluorooctowy (TFA) zastosowano do odszczepienia peptydu od żywicy w Fmoc-SPPS i do usunięcia grup zabezpieczających pochodzących z tBu.

TFMSA (program TFMSA)

Kwas trifluorometanosulfonowy (TFMSA) jest silniejszym kwasem niż TFA. TFMSA można stosować jako bezpieczniejszą alternatywę dla wysoce toksycznego HF w końcowym etapie rozszczepiania w strategii Boc-SPPS.

Tle

L-tert-leucyna (Tle) jest niepolarnym aminokwasem z wymagającymi przestrzennie łańcuchami bocznymi, który destabilizuje -helisy.

Łomot

2,4,6-Trimetoksybenzyl to nietrwała w środowisku kwasowym amidowa grupa zabezpieczająca Asn i Gln stosowana w Fmoc-SPPS.

Tos

Tosyl stosuje się jako grupę zabezpieczającą dla guanidyny i imidazolu w Boc-SPPS i można go usunąć za pomocą Na/NH3

Trt

Trityl (Trt) to nietrwała w środowisku kwasowym grupa zabezpieczająca stosowana dla reszt Asn, Cys, Gln i His w Fmoc-SPPS. Można go selektywnie usunąć za pomocą kwasu trifluorooctowego (TFA).

Biały liofilizowany proszek

Czyste peptydy zazwyczaj występują w postaci białego proszku po liofilizacji.

VIP-a

Wazoaktywny peptyd jelitowy (VIP) to 28-peptyd aminokwasowy należący do nadrodziny peptydów glukagon-grelina-sekretyna.

Xan powiedział:

9-Ksanthydryl (Xan) to nietrwała w środowisku kwasowym amidowa grupa zabezpieczająca wykorzystywana dla reszt Asn i Gln w Boc-SPPS. Xan można selektywnie usunąć za pomocą TFA.

Żółty liofilizowany proszek

Gdy peptyd jest znakowany fluoresceiną FAM, liofilizowany proszek zazwyczaj wykazuje żółty wygląd.

Z-benzyloksykarbonyl, w skrócie Z lub Cbz, stosuje się jako grupę zabezpieczającą grupę aminową w syntezie peptydów. Można go usunąć za pomocą wodorolizy lub mocnych kwasów, takich jak czysty HF lub HBr/kwas octowy.

Słowniczek

Telefon

Adres

Adres e-mail

Słowniczek